Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp3a44Q9EQW4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp3a44Q9EQW4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp3a44Q9EQW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp3a44Q9EQW4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp3a44Q9EQW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp3a44Q9EQW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp3a44Q9EQW4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp3a44Q9EQW4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp3a44Q9EQW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp3a44Q9EQW4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp3a44Q9EQW4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp3a44Q9EQW4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp3a44Q9EQW4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp3a44Q9EQW4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp3a44Q9EQW4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp3a44Q9EQW4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp3a44Q9EQW4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp3a44Q9EQW4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp3a44Q9EQW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp3a44Q9EQW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp3a44Q9EQW4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp3a44Q9EQW4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp3a44Q9EQW4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp3a44Q9EQW4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp3a44Q9EQW4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp3a44Q9EQW4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp3a44Q9EQW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp3a44Q9EQW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp3a44Q9EQW4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp3a44Q9EQW4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms