Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI8

Mrpl46, 39S ribosomal protein L46, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl46Q9EQI8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl46Q9EQI8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrpl46Q9EQI8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl46Q9EQI8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl46Q9EQI8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl46Q9EQI8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl46Q9EQI8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl46Q9EQI8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl46Q9EQI8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl46Q9EQI8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl46Q9EQI8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl46Q9EQI8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl46Q9EQI8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl46Q9EQI8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl46Q9EQI8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl46Q9EQI8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl46Q9EQI8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms