Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf21Q9EPU5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfrsf21Q9EPU5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfrsf21Q9EPU5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf21Q9EPU5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf21Q9EPU5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf21Q9EPU5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf21Q9EPU5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf21Q9EPU5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf21Q9EPU5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf21Q9EPU5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf21Q9EPU5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf21Q9EPU5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms