Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc54Q9DAL3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc54Q9DAL3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc54Q9DAL3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc54Q9DAL3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms