Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfaip8l2Q9D8Y7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfaip8l2Q9D8Y7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfaip8l2Q9D8Y7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfaip8l2Q9D8Y7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfaip8l2Q9D8Y7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfaip8l2Q9D8Y7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfaip8l2Q9D8Y7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms