Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y0

Efhd2, EF-hand domain-containing protein D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd2Q9D8Y0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efhd2Q9D8Y0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efhd2Q9D8Y0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efhd2Q9D8Y0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efhd2Q9D8Y0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efhd2Q9D8Y0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Efhd2Q9D8Y0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efhd2Q9D8Y0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efhd2Q9D8Y0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Efhd2Q9D8Y0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efhd2Q9D8Y0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efhd2Q9D8Y0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efhd2Q9D8Y0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efhd2Q9D8Y0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efhd2Q9D8Y0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efhd2Q9D8Y0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efhd2Q9D8Y0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efhd2Q9D8Y0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efhd2Q9D8Y0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efhd2Q9D8Y0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efhd2Q9D8Y0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efhd2Q9D8Y0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efhd2Q9D8Y0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efhd2Q9D8Y0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Efhd2Q9D8Y0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efhd2Q9D8Y0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efhd2Q9D8Y0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efhd2Q9D8Y0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efhd2Q9D8Y0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efhd2Q9D8Y0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhd2Q9D8Y0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhd2Q9D8Y0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efhd2Q9D8Y0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efhd2Q9D8Y0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efhd2Q9D8Y0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efhd2Q9D8Y0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efhd2Q9D8Y0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efhd2Q9D8Y0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efhd2Q9D8Y0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efhd2Q9D8Y0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efhd2Q9D8Y0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efhd2Q9D8Y0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efhd2Q9D8Y0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efhd2Q9D8Y0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Efhd2Q9D8Y0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efhd2Q9D8Y0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efhd2Q9D8Y0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efhd2Q9D8Y0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efhd2Q9D8Y0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efhd2Q9D8Y0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efhd2Q9D8Y0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Efhd2Q9D8Y0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efhd2Q9D8Y0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms