Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a3Q9D658 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptp4a3Q9D658 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptp4a3Q9D658 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptp4a3Q9D658 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptp4a3Q9D658 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptp4a3Q9D658 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptp4a3Q9D658 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptp4a3Q9D658 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptp4a3Q9D658 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptp4a3Q9D658 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptp4a3Q9D658 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptp4a3Q9D658 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptp4a3Q9D658 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptp4a3Q9D658 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptp4a3Q9D658 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptp4a3Q9D658 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptp4a3Q9D658 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptp4a3Q9D658 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptp4a3Q9D658 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptp4a3Q9D658 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptp4a3Q9D658 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptp4a3Q9D658 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptp4a3Q9D658 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptp4a3Q9D658 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptp4a3Q9D658 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptp4a3Q9D658 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptp4a3Q9D658 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptp4a3Q9D658 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptp4a3Q9D658 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms