Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubxn11Q9D572 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubxn11Q9D572 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubxn11Q9D572 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubxn11Q9D572 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubxn11Q9D572 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubxn11Q9D572 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubxn11Q9D572 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubxn11Q9D572 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubxn11Q9D572 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubxn11Q9D572 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubxn11Q9D572 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubxn11Q9D572 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubxn11Q9D572 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubxn11Q9D572 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubxn11Q9D572 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubxn11Q9D572 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubxn11Q9D572 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubxn11Q9D572 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubxn11Q9D572 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubxn11Q9D572 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubxn11Q9D572 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubxn11Q9D572 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubxn11Q9D572 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubxn11Q9D572 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubxn11Q9D572 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ubxn11Q9D572 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ubxn11Q9D572 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ubxn11Q9D572 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ubxn11Q9D572 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn11Q9D572 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn11Q9D572 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn11Q9D572 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ubxn11Q9D572 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ubxn11Q9D572 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ubxn11Q9D572 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ubxn11Q9D572 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ubxn11Q9D572 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn11Q9D572 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn11Q9D572 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubxn11Q9D572 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ubxn11Q9D572 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubxn11Q9D572 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubxn11Q9D572 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubxn11Q9D572 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubxn11Q9D572 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ubxn11Q9D572 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn11Q9D572 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn11Q9D572 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn11Q9D572 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn11Q9D572 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn11Q9D572 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn11Q9D572 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn11Q9D572 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubxn11Q9D572 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubxn11Q9D572 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubxn11Q9D572 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubxn11Q9D572 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn11Q9D572 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubxn11Q9D572 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms