Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,2
Ccdc7Q9D541 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Ccdc7Q9D541 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Ccdc7Q9D541 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Ccdc7Q9D541 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ccdc7Q9D541 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ccdc7Q9D541 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Ccdc7Q9D541 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Ccdc7Q9D541 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ccdc7Q9D541 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ccdc7Q9D541 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ccdc7Q9D541 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ccdc7Q9D541 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ccdc7Q9D541 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Ccdc7Q9D541 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Ccdc7Q9D541 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Ccdc7Q9D541 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ccdc7Q9D541 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Ccdc7Q9D541 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ccdc7Q9D541 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ccdc7Q9D541 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ccdc7Q9D541 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ccdc7Q9D541 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ccdc7Q9D541 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ccdc7Q9D541 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Ccdc7Q9D541 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Ccdc7Q9D541 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ccdc7Q9D541 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ccdc7Q9D541 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ccdc7Q9D541 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Ccdc7Q9D541 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Ccdc7Q9D541 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ccdc7Q9D541 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ccdc7Q9D541 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Ccdc7Q9D541 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ccdc7Q9D541 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ccdc7Q9D541 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ccdc7Q9D541 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ccdc7Q9D541 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ccdc7Q9D541 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ccdc7Q9D541 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ccdc7Q9D541 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ccdc7Q9D541 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ccdc7Q9D541 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,6 ms