Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
4930556J24RikQ9D4U7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930556J24RikQ9D4U7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930556J24RikQ9D4U7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930556J24RikQ9D4U7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms