Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc105Q9D4K7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc105Q9D4K7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc105Q9D4K7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc105Q9D4K7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc105Q9D4K7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc105Q9D4K7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc105Q9D4K7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc105Q9D4K7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc105Q9D4K7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc105Q9D4K7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc105Q9D4K7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc105Q9D4K7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc105Q9D4K7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc105Q9D4K7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc105Q9D4K7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc105Q9D4K7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc105Q9D4K7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc105Q9D4K7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc105Q9D4K7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc105Q9D4K7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc105Q9D4K7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc105Q9D4K7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc105Q9D4K7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc105Q9D4K7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc105Q9D4K7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc105Q9D4K7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc105Q9D4K7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc105Q9D4K7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc105Q9D4K7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc105Q9D4K7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc105Q9D4K7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc105Q9D4K7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc105Q9D4K7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc105Q9D4K7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc105Q9D4K7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc105Q9D4K7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc105Q9D4K7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc105Q9D4K7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc105Q9D4K7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc105Q9D4K7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc105Q9D4K7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc105Q9D4K7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc105Q9D4K7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc105Q9D4K7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc105Q9D4K7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc105Q9D4K7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc105Q9D4K7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc105Q9D4K7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1043.7 ms