Protein–RNA interactions for Protein: Q9D411

Tssk4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk4Q9D411 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk4Q9D411 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk4Q9D411 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk4Q9D411 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk4Q9D411 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tssk4Q9D411 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tssk4Q9D411 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk4Q9D411 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tssk4Q9D411 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tssk4Q9D411 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tssk4Q9D411 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms