Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a4cQ9D3F6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a4cQ9D3F6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a4cQ9D3F6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ms4a4cQ9D3F6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ms4a4cQ9D3F6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ms4a4cQ9D3F6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ms4a4cQ9D3F6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ms4a4cQ9D3F6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ms4a4cQ9D3F6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ms4a4cQ9D3F6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ms4a4cQ9D3F6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ms4a4cQ9D3F6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ms4a4cQ9D3F6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ms4a4cQ9D3F6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ms4a4cQ9D3F6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ms4a4cQ9D3F6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ms4a4cQ9D3F6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a4cQ9D3F6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ms4a4cQ9D3F6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms