Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt20Q9D312 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt20Q9D312 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt20Q9D312 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt20Q9D312 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt20Q9D312 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt20Q9D312 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt20Q9D312 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Krt20Q9D312 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt20Q9D312 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt20Q9D312 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt20Q9D312 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt20Q9D312 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt20Q9D312 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt20Q9D312 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt20Q9D312 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt20Q9D312 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt20Q9D312 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt20Q9D312 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt20Q9D312 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt20Q9D312 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt20Q9D312 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt20Q9D312 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt20Q9D312 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt20Q9D312 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt20Q9D312 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt20Q9D312 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt20Q9D312 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt20Q9D312 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt20Q9D312 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt20Q9D312 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt20Q9D312 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt20Q9D312 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt20Q9D312 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt20Q9D312 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt20Q9D312 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt20Q9D312 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt20Q9D312 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt20Q9D312 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt20Q9D312 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt20Q9D312 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt20Q9D312 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt20Q9D312 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt20Q9D312 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt20Q9D312 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt20Q9D312 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt20Q9D312 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt20Q9D312 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt20Q9D312 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt20Q9D312 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt20Q9D312 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt20Q9D312 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt20Q9D312 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt20Q9D312 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt20Q9D312 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt20Q9D312 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt20Q9D312 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt20Q9D312 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt20Q9D312 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt20Q9D312 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt20Q9D312 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms