Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rasgef1cQ9D300 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rasgef1cQ9D300 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rasgef1cQ9D300 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rasgef1cQ9D300 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rasgef1cQ9D300 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rasgef1cQ9D300 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rasgef1cQ9D300 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rasgef1cQ9D300 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rasgef1cQ9D300 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rasgef1cQ9D300 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rasgef1cQ9D300 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rasgef1cQ9D300 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rasgef1cQ9D300 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rasgef1cQ9D300 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rasgef1cQ9D300 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rasgef1cQ9D300 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rasgef1cQ9D300 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rasgef1cQ9D300 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rasgef1cQ9D300 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rasgef1cQ9D300 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rasgef1cQ9D300 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rasgef1cQ9D300 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rasgef1cQ9D300 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rasgef1cQ9D300 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rasgef1cQ9D300 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rasgef1cQ9D300 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rasgef1cQ9D300 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rasgef1cQ9D300 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rasgef1cQ9D300 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rasgef1cQ9D300 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rasgef1cQ9D300 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rasgef1cQ9D300 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rasgef1cQ9D300 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rasgef1cQ9D300 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rasgef1cQ9D300 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rasgef1cQ9D300 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rasgef1cQ9D300 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasgef1cQ9D300 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms