Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
1700034E13RikQ9D2T6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700034E13RikQ9D2T6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
1700034E13RikQ9D2T6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700034E13RikQ9D2T6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms