Protein–RNA interactions for Protein: Q9D260

9230112D13Rik, RIKEN cDNA 9230112D13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230112D13RikQ9D260 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
9230112D13RikQ9D260 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
9230112D13RikQ9D260 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
9230112D13RikQ9D260 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
9230112D13RikQ9D260 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
9230112D13RikQ9D260 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
9230112D13RikQ9D260 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
9230112D13RikQ9D260 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
9230112D13RikQ9D260 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
9230112D13RikQ9D260 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
9230112D13RikQ9D260 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9230112D13RikQ9D260 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9230112D13RikQ9D260 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
9230112D13RikQ9D260 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
9230112D13RikQ9D260 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
9230112D13RikQ9D260 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
9230112D13RikQ9D260 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
9230112D13RikQ9D260 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
9230112D13RikQ9D260 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
9230112D13RikQ9D260 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
9230112D13RikQ9D260 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
9230112D13RikQ9D260 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
9230112D13RikQ9D260 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9230112D13RikQ9D260 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9230112D13RikQ9D260 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
9230112D13RikQ9D260 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
9230112D13RikQ9D260 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
9230112D13RikQ9D260 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
9230112D13RikQ9D260 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
9230112D13RikQ9D260 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
9230112D13RikQ9D260 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
9230112D13RikQ9D260 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
9230112D13RikQ9D260 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
9230112D13RikQ9D260 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
9230112D13RikQ9D260 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
9230112D13RikQ9D260 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
9230112D13RikQ9D260 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
9230112D13RikQ9D260 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
9230112D13RikQ9D260 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
9230112D13RikQ9D260 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
9230112D13RikQ9D260 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms