Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZV8

Fbxl20, F-box/LRR-repeat protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl20Q9CZV8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxl20Q9CZV8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbxl20Q9CZV8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxl20Q9CZV8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxl20Q9CZV8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxl20Q9CZV8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxl20Q9CZV8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxl20Q9CZV8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxl20Q9CZV8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxl20Q9CZV8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxl20Q9CZV8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxl20Q9CZV8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxl20Q9CZV8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxl20Q9CZV8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxl20Q9CZV8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxl20Q9CZV8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxl20Q9CZV8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxl20Q9CZV8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxl20Q9CZV8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxl20Q9CZV8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxl20Q9CZV8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxl20Q9CZV8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxl20Q9CZV8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxl20Q9CZV8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms