Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG3

Commd8, COMM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd8Q9CZG3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Commd8Q9CZG3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Commd8Q9CZG3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Commd8Q9CZG3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Commd8Q9CZG3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Commd8Q9CZG3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Commd8Q9CZG3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Commd8Q9CZG3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Commd8Q9CZG3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Commd8Q9CZG3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Commd8Q9CZG3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Commd8Q9CZG3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Commd8Q9CZG3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Commd8Q9CZG3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Commd8Q9CZG3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Commd8Q9CZG3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Commd8Q9CZG3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Commd8Q9CZG3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Commd8Q9CZG3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Commd8Q9CZG3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Commd8Q9CZG3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Commd8Q9CZG3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Commd8Q9CZG3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Commd8Q9CZG3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Commd8Q9CZG3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Commd8Q9CZG3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Commd8Q9CZG3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Commd8Q9CZG3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Commd8Q9CZG3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Commd8Q9CZG3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Commd8Q9CZG3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Commd8Q9CZG3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Commd8Q9CZG3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Commd8Q9CZG3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Commd8Q9CZG3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms