Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sgo1Q9CXH7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sgo1Q9CXH7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sgo1Q9CXH7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sgo1Q9CXH7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sgo1Q9CXH7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sgo1Q9CXH7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sgo1Q9CXH7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sgo1Q9CXH7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sgo1Q9CXH7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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