Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx2Q9CWK8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx2Q9CWK8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx2Q9CWK8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snx2Q9CWK8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx2Q9CWK8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx2Q9CWK8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx2Q9CWK8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx2Q9CWK8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx2Q9CWK8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx2Q9CWK8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx2Q9CWK8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx2Q9CWK8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx2Q9CWK8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx2Q9CWK8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx2Q9CWK8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx2Q9CWK8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx2Q9CWK8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx2Q9CWK8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx2Q9CWK8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx2Q9CWK8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx2Q9CWK8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx2Q9CWK8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx2Q9CWK8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx2Q9CWK8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx2Q9CWK8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx2Q9CWK8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx2Q9CWK8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx2Q9CWK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx2Q9CWK8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms