Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRZ8

Tspo2, Translocator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspo2Q9CRZ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspo2Q9CRZ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspo2Q9CRZ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspo2Q9CRZ8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms