Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccer1Q9CQL2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccer1Q9CQL2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccer1Q9CQL2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccer1Q9CQL2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccer1Q9CQL2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccer1Q9CQL2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer1Q9CQL2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer1Q9CQL2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer1Q9CQL2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer1Q9CQL2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer1Q9CQL2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer1Q9CQL2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccer1Q9CQL2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccer1Q9CQL2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccer1Q9CQL2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccer1Q9CQL2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccer1Q9CQL2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccer1Q9CQL2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccer1Q9CQL2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccer1Q9CQL2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccer1Q9CQL2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccer1Q9CQL2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccer1Q9CQL2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccer1Q9CQL2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccer1Q9CQL2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer1Q9CQL2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer1Q9CQL2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer1Q9CQL2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccer1Q9CQL2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccer1Q9CQL2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccer1Q9CQL2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccer1Q9CQL2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer1Q9CQL2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccer1Q9CQL2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccer1Q9CQL2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccer1Q9CQL2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccer1Q9CQL2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccer1Q9CQL2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccer1Q9CQL2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccer1Q9CQL2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccer1Q9CQL2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccer1Q9CQL2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccer1Q9CQL2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccer1Q9CQL2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccer1Q9CQL2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccer1Q9CQL2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccer1Q9CQL2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccer1Q9CQL2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccer1Q9CQL2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccer1Q9CQL2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccer1Q9CQL2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccer1Q9CQL2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccer1Q9CQL2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccer1Q9CQL2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccer1Q9CQL2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccer1Q9CQL2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccer1Q9CQL2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccer1Q9CQL2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccer1Q9CQL2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccer1Q9CQL2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccer1Q9CQL2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccer1Q9CQL2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccer1Q9CQL2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccer1Q9CQL2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccer1Q9CQL2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccer1Q9CQL2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccer1Q9CQL2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.9 ms