Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Ubl4bQ9CQ84 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Ubl4bQ9CQ84 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
Ubl4bQ9CQ84 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC42.94■■■■■ 4.46
Ubl4bQ9CQ84 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
Ubl4bQ9CQ84 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Ubl4bQ9CQ84 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
Ubl4bQ9CQ84 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Ubl4bQ9CQ84 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
Ubl4bQ9CQ84 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
Ubl4bQ9CQ84 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Ubl4bQ9CQ84 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
Ubl4bQ9CQ84 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Ubl4bQ9CQ84 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
Ubl4bQ9CQ84 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC42.84■■■■■ 4.45
Ubl4bQ9CQ84 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Ubl4bQ9CQ84 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Ubl4bQ9CQ84 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
Ubl4bQ9CQ84 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Ubl4bQ9CQ84 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Ubl4bQ9CQ84 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Ubl4bQ9CQ84 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Ubl4bQ9CQ84 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Ubl4bQ9CQ84 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Ubl4bQ9CQ84 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Ubl4bQ9CQ84 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
Ubl4bQ9CQ84 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Ubl4bQ9CQ84 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Ubl4bQ9CQ84 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Ubl4bQ9CQ84 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Ubl4bQ9CQ84 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Ubl4bQ9CQ84 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
Ubl4bQ9CQ84 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
Ubl4bQ9CQ84 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Ubl4bQ9CQ84 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
Ubl4bQ9CQ84 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
Ubl4bQ9CQ84 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
Ubl4bQ9CQ84 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Ubl4bQ9CQ84 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Ubl4bQ9CQ84 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Ubl4bQ9CQ84 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
Ubl4bQ9CQ84 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Ubl4bQ9CQ84 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Ubl4bQ9CQ84 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Ubl4bQ9CQ84 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Ubl4bQ9CQ84 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
Ubl4bQ9CQ84 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Ubl4bQ9CQ84 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
Ubl4bQ9CQ84 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.4
Ubl4bQ9CQ84 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Ubl4bQ9CQ84 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Ubl4bQ9CQ84 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Ubl4bQ9CQ84 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Ubl4bQ9CQ84 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Ubl4bQ9CQ84 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Ubl4bQ9CQ84 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Ubl4bQ9CQ84 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Ubl4bQ9CQ84 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
Ubl4bQ9CQ84 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Ubl4bQ9CQ84 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
Ubl4bQ9CQ84 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
Ubl4bQ9CQ84 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Ubl4bQ9CQ84 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Ubl4bQ9CQ84 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Ubl4bQ9CQ84 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Ubl4bQ9CQ84 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Ubl4bQ9CQ84 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Ubl4bQ9CQ84 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Ubl4bQ9CQ84 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Ubl4bQ9CQ84 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Ubl4bQ9CQ84 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Ubl4bQ9CQ84 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
Ubl4bQ9CQ84 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
Ubl4bQ9CQ84 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Ubl4bQ9CQ84 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Ubl4bQ9CQ84 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Ubl4bQ9CQ84 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Ubl4bQ9CQ84 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Ubl4bQ9CQ84 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Ubl4bQ9CQ84 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Ubl4bQ9CQ84 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Ubl4bQ9CQ84 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Ubl4bQ9CQ84 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms