Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
StambpQ9CQ26 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
StambpQ9CQ26 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
StambpQ9CQ26 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
StambpQ9CQ26 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
StambpQ9CQ26 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
StambpQ9CQ26 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
StambpQ9CQ26 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
StambpQ9CQ26 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
StambpQ9CQ26 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
StambpQ9CQ26 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
StambpQ9CQ26 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
StambpQ9CQ26 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
StambpQ9CQ26 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
StambpQ9CQ26 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
StambpQ9CQ26 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
StambpQ9CQ26 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
StambpQ9CQ26 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
StambpQ9CQ26 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
StambpQ9CQ26 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
StambpQ9CQ26 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
StambpQ9CQ26 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
StambpQ9CQ26 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
StambpQ9CQ26 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
StambpQ9CQ26 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
StambpQ9CQ26 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
StambpQ9CQ26 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
StambpQ9CQ26 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
StambpQ9CQ26 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
StambpQ9CQ26 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms