Protein–RNA interactions for Protein: Q99P50

Ghsr, Growth hormone secretagogue receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhsrQ99P50 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GhsrQ99P50 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GhsrQ99P50 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GhsrQ99P50 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GhsrQ99P50 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GhsrQ99P50 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GhsrQ99P50 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GhsrQ99P50 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms