Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a4dQ99N05 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a4dQ99N05 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a4dQ99N05 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a4dQ99N05 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a4dQ99N05 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ms4a4dQ99N05 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ms4a4dQ99N05 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a4dQ99N05 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a4dQ99N05 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a4dQ99N05 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a4dQ99N05 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a4dQ99N05 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a4dQ99N05 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms