Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubxn2aQ99KJ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ubxn2aQ99KJ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ubxn2aQ99KJ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ubxn2aQ99KJ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms