Protein–RNA interactions for Protein: Q924W6

Trim66, Tripartite motif-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim66Q924W6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Trim66Q924W6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Trim66Q924W6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Trim66Q924W6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Trim66Q924W6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Trim66Q924W6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Trim66Q924W6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Trim66Q924W6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Trim66Q924W6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Trim66Q924W6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Trim66Q924W6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Trim66Q924W6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Trim66Q924W6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25,08■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Trim66Q924W6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Trim66Q924W6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Trim66Q924W6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Trim66Q924W6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Trim66Q924W6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Trim66Q924W6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Trim66Q924W6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Trim66Q924W6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Trim66Q924W6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Trim66Q924W6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Trim66Q924W6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Trim66Q924W6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Trim66Q924W6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Trim66Q924W6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Trim66Q924W6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24,89■■□□□ 1,58
Trim66Q924W6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24,89■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24,83■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Trim66Q924W6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Trim66Q924W6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Trim66Q924W6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Trim66Q924W6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Trim66Q924W6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Trim66Q924W6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Trim66Q924W6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Trim66Q924W6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Trim66Q924W6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Trim66Q924W6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Trim66Q924W6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Trim66Q924W6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Trim66Q924W6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Trim66Q924W6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Trim66Q924W6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Trim66Q924W6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Trim66Q924W6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Trim66Q924W6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Trim66Q924W6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46,9 ms