Protein–RNA interactions for Protein: Q921E6

Eed, Polycomb protein EED, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EedQ921E6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EedQ921E6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EedQ921E6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EedQ921E6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EedQ921E6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EedQ921E6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EedQ921E6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EedQ921E6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EedQ921E6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EedQ921E6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EedQ921E6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EedQ921E6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EedQ921E6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EedQ921E6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EedQ921E6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EedQ921E6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EedQ921E6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EedQ921E6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EedQ921E6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EedQ921E6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EedQ921E6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EedQ921E6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EedQ921E6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EedQ921E6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EedQ921E6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EedQ921E6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EedQ921E6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EedQ921E6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EedQ921E6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EedQ921E6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EedQ921E6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EedQ921E6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EedQ921E6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EedQ921E6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EedQ921E6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EedQ921E6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EedQ921E6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EedQ921E6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EedQ921E6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EedQ921E6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EedQ921E6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EedQ921E6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EedQ921E6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EedQ921E6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EedQ921E6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EedQ921E6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EedQ921E6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EedQ921E6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EedQ921E6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EedQ921E6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EedQ921E6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EedQ921E6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EedQ921E6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EedQ921E6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EedQ921E6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EedQ921E6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EedQ921E6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EedQ921E6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EedQ921E6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EedQ921E6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EedQ921E6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EedQ921E6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EedQ921E6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EedQ921E6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EedQ921E6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EedQ921E6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EedQ921E6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EedQ921E6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EedQ921E6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EedQ921E6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EedQ921E6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EedQ921E6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EedQ921E6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EedQ921E6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EedQ921E6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EedQ921E6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EedQ921E6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EedQ921E6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EedQ921E6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EedQ921E6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EedQ921E6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EedQ921E6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EedQ921E6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EedQ921E6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EedQ921E6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms