Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prpf6Q91YR7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prpf6Q91YR7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prpf6Q91YR7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prpf6Q91YR7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Prpf6Q91YR7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prpf6Q91YR7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prpf6Q91YR7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prpf6Q91YR7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prpf6Q91YR7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prpf6Q91YR7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prpf6Q91YR7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prpf6Q91YR7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prpf6Q91YR7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prpf6Q91YR7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prpf6Q91YR7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prpf6Q91YR7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prpf6Q91YR7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prpf6Q91YR7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prpf6Q91YR7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prpf6Q91YR7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prpf6Q91YR7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Prpf6Q91YR7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prpf6Q91YR7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prpf6Q91YR7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prpf6Q91YR7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prpf6Q91YR7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prpf6Q91YR7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prpf6Q91YR7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prpf6Q91YR7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prpf6Q91YR7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prpf6Q91YR7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prpf6Q91YR7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prpf6Q91YR7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prpf6Q91YR7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prpf6Q91YR7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prpf6Q91YR7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prpf6Q91YR7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prpf6Q91YR7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prpf6Q91YR7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prpf6Q91YR7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Prpf6Q91YR7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prpf6Q91YR7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prpf6Q91YR7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prpf6Q91YR7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prpf6Q91YR7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prpf6Q91YR7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Prpf6Q91YR7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpf6Q91YR7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms