Protein–RNA interactions for Protein: Q91YL3

Uckl1, Uridine-cytidine kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uckl1Q91YL3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uckl1Q91YL3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uckl1Q91YL3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uckl1Q91YL3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uckl1Q91YL3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uckl1Q91YL3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uckl1Q91YL3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uckl1Q91YL3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uckl1Q91YL3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uckl1Q91YL3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uckl1Q91YL3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uckl1Q91YL3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Uckl1Q91YL3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uckl1Q91YL3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uckl1Q91YL3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uckl1Q91YL3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uckl1Q91YL3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uckl1Q91YL3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uckl1Q91YL3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uckl1Q91YL3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uckl1Q91YL3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uckl1Q91YL3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uckl1Q91YL3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uckl1Q91YL3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uckl1Q91YL3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uckl1Q91YL3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uckl1Q91YL3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uckl1Q91YL3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uckl1Q91YL3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uckl1Q91YL3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uckl1Q91YL3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uckl1Q91YL3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uckl1Q91YL3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms