Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usb1Q91W78 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usb1Q91W78 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usb1Q91W78 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usb1Q91W78 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usb1Q91W78 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usb1Q91W78 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usb1Q91W78 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usb1Q91W78 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usb1Q91W78 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usb1Q91W78 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usb1Q91W78 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usb1Q91W78 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usb1Q91W78 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usb1Q91W78 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usb1Q91W78 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usb1Q91W78 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usb1Q91W78 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usb1Q91W78 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usb1Q91W78 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usb1Q91W78 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usb1Q91W78 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usb1Q91W78 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usb1Q91W78 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usb1Q91W78 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usb1Q91W78 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usb1Q91W78 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usb1Q91W78 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usb1Q91W78 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usb1Q91W78 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usb1Q91W78 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usb1Q91W78 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usb1Q91W78 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usb1Q91W78 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usb1Q91W78 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usb1Q91W78 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usb1Q91W78 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms