Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc65Q8VHI7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc65Q8VHI7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc65Q8VHI7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc65Q8VHI7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc65Q8VHI7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc65Q8VHI7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc65Q8VHI7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc65Q8VHI7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc65Q8VHI7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc65Q8VHI7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc65Q8VHI7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc65Q8VHI7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc65Q8VHI7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc65Q8VHI7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc65Q8VHI7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc65Q8VHI7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc65Q8VHI7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc65Q8VHI7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc65Q8VHI7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc65Q8VHI7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc65Q8VHI7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc65Q8VHI7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc65Q8VHI7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc65Q8VHI7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc65Q8VHI7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc65Q8VHI7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc65Q8VHI7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc65Q8VHI7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc65Q8VHI7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc65Q8VHI7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms