Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf130Q8VEM1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf130Q8VEM1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf130Q8VEM1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf130Q8VEM1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf130Q8VEM1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf130Q8VEM1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf130Q8VEM1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf130Q8VEM1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf130Q8VEM1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf130Q8VEM1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf130Q8VEM1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf130Q8VEM1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf130Q8VEM1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf130Q8VEM1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf130Q8VEM1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf130Q8VEM1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf130Q8VEM1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf130Q8VEM1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf130Q8VEM1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf130Q8VEM1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf130Q8VEM1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf130Q8VEM1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf130Q8VEM1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf130Q8VEM1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf130Q8VEM1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf130Q8VEM1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf130Q8VEM1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf130Q8VEM1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf130Q8VEM1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf130Q8VEM1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf130Q8VEM1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf130Q8VEM1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf130Q8VEM1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf130Q8VEM1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms