Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Alg12Q8VDB2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Alg12Q8VDB2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Alg12Q8VDB2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Alg12Q8VDB2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Alg12Q8VDB2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Alg12Q8VDB2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms