Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gle1Q8R322 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gle1Q8R322 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gle1Q8R322 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gle1Q8R322 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gle1Q8R322 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gle1Q8R322 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gle1Q8R322 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gle1Q8R322 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gle1Q8R322 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gle1Q8R322 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gle1Q8R322 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gle1Q8R322 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gle1Q8R322 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gle1Q8R322 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gle1Q8R322 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gle1Q8R322 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gle1Q8R322 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gle1Q8R322 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gle1Q8R322 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gle1Q8R322 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gle1Q8R322 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gle1Q8R322 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gle1Q8R322 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gle1Q8R322 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gle1Q8R322 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gle1Q8R322 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gle1Q8R322 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gle1Q8R322 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gle1Q8R322 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gle1Q8R322 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms