Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Vps37bQ8R0J7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Vps37bQ8R0J7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Vps37bQ8R0J7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Vps37bQ8R0J7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Vps37bQ8R0J7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Vps37bQ8R0J7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24,69■■□□□ 1,54
Vps37bQ8R0J7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Vps37bQ8R0J7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Vps37bQ8R0J7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Vps37bQ8R0J7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Vps37bQ8R0J7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Vps37bQ8R0J7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Vps37bQ8R0J7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Vps37bQ8R0J7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Vps37bQ8R0J7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Vps37bQ8R0J7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Vps37bQ8R0J7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Vps37bQ8R0J7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Vps37bQ8R0J7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Vps37bQ8R0J7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Vps37bQ8R0J7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Vps37bQ8R0J7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Vps37bQ8R0J7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Vps37bQ8R0J7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Vps37bQ8R0J7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Vps37bQ8R0J7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Vps37bQ8R0J7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Vps37bQ8R0J7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Vps37bQ8R0J7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Vps37bQ8R0J7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Vps37bQ8R0J7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24,54■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Vps37bQ8R0J7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Vps37bQ8R0J7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Vps37bQ8R0J7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54,5 ms