Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colec12Q8K4Q8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colec12Q8K4Q8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colec12Q8K4Q8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Colec12Q8K4Q8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Colec12Q8K4Q8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Colec12Q8K4Q8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Colec12Q8K4Q8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Colec12Q8K4Q8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Colec12Q8K4Q8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Colec12Q8K4Q8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Colec12Q8K4Q8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Colec12Q8K4Q8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Colec12Q8K4Q8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Colec12Q8K4Q8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Colec12Q8K4Q8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Colec12Q8K4Q8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Colec12Q8K4Q8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Colec12Q8K4Q8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Colec12Q8K4Q8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Colec12Q8K4Q8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Colec12Q8K4Q8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Colec12Q8K4Q8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Colec12Q8K4Q8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms