Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pnpt1Q8K1R3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pnpt1Q8K1R3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pnpt1Q8K1R3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pnpt1Q8K1R3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pnpt1Q8K1R3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pnpt1Q8K1R3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pnpt1Q8K1R3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pnpt1Q8K1R3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pnpt1Q8K1R3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pnpt1Q8K1R3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pnpt1Q8K1R3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpt1Q8K1R3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpt1Q8K1R3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpt1Q8K1R3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnpt1Q8K1R3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pnpt1Q8K1R3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pnpt1Q8K1R3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnpt1Q8K1R3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pnpt1Q8K1R3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pnpt1Q8K1R3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pnpt1Q8K1R3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms