Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh2d5Q8JZW5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh2d5Q8JZW5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh2d5Q8JZW5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh2d5Q8JZW5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh2d5Q8JZW5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh2d5Q8JZW5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh2d5Q8JZW5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh2d5Q8JZW5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh2d5Q8JZW5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh2d5Q8JZW5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh2d5Q8JZW5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh2d5Q8JZW5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh2d5Q8JZW5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh2d5Q8JZW5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh2d5Q8JZW5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh2d5Q8JZW5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh2d5Q8JZW5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh2d5Q8JZW5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh2d5Q8JZW5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh2d5Q8JZW5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh2d5Q8JZW5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh2d5Q8JZW5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sh2d5Q8JZW5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh2d5Q8JZW5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh2d5Q8JZW5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh2d5Q8JZW5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh2d5Q8JZW5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh2d5Q8JZW5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh2d5Q8JZW5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh2d5Q8JZW5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh2d5Q8JZW5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh2d5Q8JZW5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh2d5Q8JZW5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh2d5Q8JZW5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh2d5Q8JZW5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh2d5Q8JZW5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh2d5Q8JZW5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh2d5Q8JZW5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sh2d5Q8JZW5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sh2d5Q8JZW5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh2d5Q8JZW5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh2d5Q8JZW5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh2d5Q8JZW5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh2d5Q8JZW5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh2d5Q8JZW5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh2d5Q8JZW5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh2d5Q8JZW5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh2d5Q8JZW5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sh2d5Q8JZW5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms