Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc73Q8CDM4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc73Q8CDM4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc73Q8CDM4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc73Q8CDM4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc73Q8CDM4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc73Q8CDM4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc73Q8CDM4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc73Q8CDM4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc73Q8CDM4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc73Q8CDM4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc73Q8CDM4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc73Q8CDM4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc73Q8CDM4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc73Q8CDM4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc73Q8CDM4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc73Q8CDM4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc73Q8CDM4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc73Q8CDM4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc73Q8CDM4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc73Q8CDM4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms