Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY0

Gatc, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatcQ8CBY0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GatcQ8CBY0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GatcQ8CBY0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GatcQ8CBY0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GatcQ8CBY0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GatcQ8CBY0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GatcQ8CBY0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GatcQ8CBY0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GatcQ8CBY0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GatcQ8CBY0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GatcQ8CBY0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GatcQ8CBY0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GatcQ8CBY0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GatcQ8CBY0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GatcQ8CBY0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GatcQ8CBY0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GatcQ8CBY0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GatcQ8CBY0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GatcQ8CBY0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GatcQ8CBY0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GatcQ8CBY0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GatcQ8CBY0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GatcQ8CBY0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GatcQ8CBY0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GatcQ8CBY0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GatcQ8CBY0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GatcQ8CBY0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GatcQ8CBY0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GatcQ8CBY0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GatcQ8CBY0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GatcQ8CBY0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GatcQ8CBY0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GatcQ8CBY0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GatcQ8CBY0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GatcQ8CBY0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GatcQ8CBY0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GatcQ8CBY0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GatcQ8CBY0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GatcQ8CBY0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GatcQ8CBY0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GatcQ8CBY0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GatcQ8CBY0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GatcQ8CBY0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GatcQ8CBY0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GatcQ8CBY0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GatcQ8CBY0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GatcQ8CBY0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GatcQ8CBY0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GatcQ8CBY0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GatcQ8CBY0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GatcQ8CBY0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GatcQ8CBY0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GatcQ8CBY0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GatcQ8CBY0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms