Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Apol9bQ8C7I4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Apol9bQ8C7I4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Apol9bQ8C7I4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Apol9bQ8C7I4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Apol9bQ8C7I4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Apol9bQ8C7I4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,72
Apol9bQ8C7I4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Apol9bQ8C7I4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Apol9bQ8C7I4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Apol9bQ8C7I4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Apol9bQ8C7I4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Apol9bQ8C7I4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Apol9bQ8C7I4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Apol9bQ8C7I4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Apol9bQ8C7I4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Apol9bQ8C7I4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
Apol9bQ8C7I4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Apol9bQ8C7I4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Apol9bQ8C7I4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Apol9bQ8C7I4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Apol9bQ8C7I4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Apol9bQ8C7I4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
Apol9bQ8C7I4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Apol9bQ8C7I4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Apol9bQ8C7I4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Apol9bQ8C7I4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Apol9bQ8C7I4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Apol9bQ8C7I4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Apol9bQ8C7I4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Apol9bQ8C7I4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Apol9bQ8C7I4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Apol9bQ8C7I4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Apol9bQ8C7I4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Apol9bQ8C7I4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Apol9bQ8C7I4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Apol9bQ8C7I4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Apol9bQ8C7I4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Apol9bQ8C7I4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Apol9bQ8C7I4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Apol9bQ8C7I4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Apol9bQ8C7I4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Apol9bQ8C7I4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Apol9bQ8C7I4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Apol9bQ8C7I4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Apol9bQ8C7I4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Apol9bQ8C7I4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Apol9bQ8C7I4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Apol9bQ8C7I4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Apol9bQ8C7I4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Apol9bQ8C7I4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Apol9bQ8C7I4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Apol9bQ8C7I4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Apol9bQ8C7I4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Apol9bQ8C7I4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Apol9bQ8C7I4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Apol9bQ8C7I4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Apol9bQ8C7I4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Apol9bQ8C7I4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Apol9bQ8C7I4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Apol9bQ8C7I4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Apol9bQ8C7I4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Apol9bQ8C7I4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Apol9bQ8C7I4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Apol9bQ8C7I4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Apol9bQ8C7I4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Apol9bQ8C7I4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms