Protein–RNA interactions for Protein: Q8C570

Rae1, mRNA export factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rae1Q8C570 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rae1Q8C570 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rae1Q8C570 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rae1Q8C570 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rae1Q8C570 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rae1Q8C570 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rae1Q8C570 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rae1Q8C570 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rae1Q8C570 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rae1Q8C570 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rae1Q8C570 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rae1Q8C570 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rae1Q8C570 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rae1Q8C570 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rae1Q8C570 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rae1Q8C570 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rae1Q8C570 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rae1Q8C570 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rae1Q8C570 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rae1Q8C570 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rae1Q8C570 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rae1Q8C570 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rae1Q8C570 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rae1Q8C570 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rae1Q8C570 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rae1Q8C570 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rae1Q8C570 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rae1Q8C570 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rae1Q8C570 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rae1Q8C570 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rae1Q8C570 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rae1Q8C570 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rae1Q8C570 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rae1Q8C570 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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