Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3M9

Uncharacterized protein C2orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3M9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8C3M9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8C3M9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8C3M9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8C3M9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8C3M9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8C3M9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8C3M9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8C3M9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8C3M9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8C3M9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8C3M9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8C3M9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C3M9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C3M9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C3M9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C3M9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C3M9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C3M9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C3M9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C3M9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q8C3M9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8C3M9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8C3M9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8C3M9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8C3M9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8C3M9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8C3M9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8C3M9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8C3M9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8C3M9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8C3M9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8C3M9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8C3M9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8C3M9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C3M9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C3M9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8C3M9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms