Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsfm13Q8BXS2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsfm13Q8BXS2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfsfm13Q8BXS2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsfm13Q8BXS2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsfm13Q8BXS2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsfm13Q8BXS2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsfm13Q8BXS2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsfm13Q8BXS2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms