Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms