Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM3

Ptpn7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn7Q8BUM3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn7Q8BUM3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn7Q8BUM3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn7Q8BUM3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn7Q8BUM3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn7Q8BUM3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn7Q8BUM3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn7Q8BUM3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn7Q8BUM3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn7Q8BUM3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn7Q8BUM3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn7Q8BUM3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn7Q8BUM3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn7Q8BUM3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn7Q8BUM3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ptpn7Q8BUM3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpn7Q8BUM3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn7Q8BUM3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn7Q8BUM3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn7Q8BUM3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn7Q8BUM3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn7Q8BUM3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn7Q8BUM3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn7Q8BUM3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn7Q8BUM3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn7Q8BUM3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn7Q8BUM3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn7Q8BUM3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn7Q8BUM3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn7Q8BUM3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn7Q8BUM3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn7Q8BUM3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn7Q8BUM3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn7Q8BUM3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn7Q8BUM3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn7Q8BUM3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn7Q8BUM3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn7Q8BUM3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn7Q8BUM3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn7Q8BUM3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn7Q8BUM3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn7Q8BUM3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn7Q8BUM3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn7Q8BUM3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn7Q8BUM3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms