Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PcgF3Q8BTQ0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PcgF3Q8BTQ0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PcgF3Q8BTQ0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PcgF3Q8BTQ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PcgF3Q8BTQ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PcgF3Q8BTQ0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcgF3Q8BTQ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcgF3Q8BTQ0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcgF3Q8BTQ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PcgF3Q8BTQ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PcgF3Q8BTQ0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PcgF3Q8BTQ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PcgF3Q8BTQ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcgF3Q8BTQ0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcgF3Q8BTQ0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcgF3Q8BTQ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PcgF3Q8BTQ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PcgF3Q8BTQ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PcgF3Q8BTQ0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PcgF3Q8BTQ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PcgF3Q8BTQ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PcgF3Q8BTQ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PcgF3Q8BTQ0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PcgF3Q8BTQ0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PcgF3Q8BTQ0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcgF3Q8BTQ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PcgF3Q8BTQ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms